Wydarzenia te zbiegły się w czasie z rocznicą objawień Matki Bożej w Fatimie – co do dnia i co do godziny. Ojciec Święty głęboko wierzył, że to Matka Boża ocaliła jego życie i mówił później: „Czyjaś ręka strzelała, ale inna Ręka prowadziła kulę”. Tuż po zamachu Jan Paweł II trafił do Polikliniki Gemelli, gdzie rozpoczęła się walka o jego życie. Pistolet Browning HP kal. 9mm, którym ranił Papieża znajduje się w Muzeum, w strefie „Przebaczam zamachowcy”.
„Radość przeplata się z bólem, mieszają się w naszym życiu kolec z różami.
Niech Najświętsza Dziewica nauczy nas przemieniać w zasługę ten los,
który często wiedzie nas, razem z Nią pod krzyż”.
Fragment niewygłoszonego przemówienia z 13 maja 1981
Wyposażenie pokoju szpitalnego, w którym Ojciec Święty wracał do zdrowia można oglądać na wystawie „Cierpienie ma sens”, którą w 2016 przygotowało Muzeum. Wśród autentycznych przedmiotów pozyskanych z Polikliniki Gemelli znajdują się: łóżko, materac, bielizna pościelowa z logo Polikliniki, szafka nocna i komplet krzeseł oraz szklana szafka na leki.
