Wśród cennych pamiątek przesłanych przez Papieża Emeryta znajdują się trzy pierścienie podarowane kard. Ratzingerowi przez Jana Pawła II, w tym najcenniejszy – złoty pierścień związany z Wielkim Jubileuszem Roku 2000. Jest też pierścień z Dobrym Pasterzem, który od Jana Pawła II otrzymywali biskupi i kardynałowie oraz srebrny pierścień z symbolem Chrystusa. Benedykt XVI przekazał także listy, które otrzymał od Papieża Polaka: dwa pisma z gratulacjami dla kardynała Ratzingera z 1992 i 2003 roku oraz list po łacinie wyznaczający Kardynała na legata papieskiego w czasie uroczystości jubileuszu 750-lecia kanonizacji św. Stanisława BM w Krakowie w 2003 roku. Wśród darów jest też fotografia wykonana w czasie Mszy św. z okazji 10. rocznicy pontyfikatu Jana Pawła II 30 X 1988 roku, przedstawiająca obu dostojników.
W liście skierowanym do Dyrektora Muzeum, Ojciec Święty Benedykt XVI napisał (…) Przeglądając poszczególne pamiątki, przewędrowałem jednocześnie przez wszystkie te lata, które mogłem spędzić wspólnie z Ojcem Świętym Janem Pawłem II, a które z perspektywy czasu stają się dla mnie jeszcze droższe i piękniejsze, gdyż z czasem coraz bardziej pojmuję wielkość Jego postaci. (…) Mam nadzieję, że swoimi podarunkami sprawię radość wielu odwiedzającym i jednocześnie będę w stanie w ten sposób pogłębić ich miłość do Ojca Świętego i do Kościoła.
Dary będzie można oglądać do końca wakacji w strefie Muzeum, gdzie prezentowana jest pobłogosławiona przez Benedykta XVI kopia Drzwi Świętych z bazyliki św. Piotra w Rzymie, a także encykliki Jana Pawła II.
Benedykt XVI odwiedził Wadowice i rodzinny dom swego Wielkiego Poprzednika 27 maja 2006 roku. Przypomina o tym przechowywany wpis w Księdze Pamiątkowej oraz ofiarowana wtedy Muzeum płaskorzeźba przedstawiająca Matkę Bożą i opatrzona papieskim herbem.
